Système multi-analyseur automatisé d’imagerie en temps réel de culture cellulaire

Les analyses actuellement menées dans le cadre des projets de recherche reposant sur des techniques de culture cellulaire et de microscopie présentent des variabilités imputables aux différentes méthodes utilisées, aux manipulations, au matériel utilisé et aux expérimentateurs. Ces variabilités persistent malgré l’existence de protocoles précis et l’organisation de sessions de formation pour les utilisateurs. De plus ces analyses demandent des misent au point complexes et peuvent parfois être très chronophage.Système multi-analyseur automatisé d’imagerie en temps réel de culture cellulaire permettrait de réduire grandement ces variabilités avec l’utilisation d’un seul appareil adossé à des protocoles fixés (validés par la communauté scientifique). Cette standardisation permettra aux personnels utilisant cet appareil un plus grand impact scientifique.Cette acquisition permettrait également un gain de temps substantiel du personnel technique, des utilisateurs et des porteurs de projets dans la prise en main de l’appareil, dans la mise en place des analyses et dans le traitement des données. Descriptif détaillé des prestations attenduesLe Système multi-analyseur automatisé d’imagerie pour culture cellulaire devra permettre de mener sur de nombreuses lignées (humaines, murines, ...) placées sur des supports de plaques versatiles (de 96 à 6 puits comme configuration minimum), des analyses en temps réel sans perturber la température ni le taux de CO2.Il devra permettre entre autres des mesures de croissance et de viabilité cellulaire, de confluence, ainsi que d’activités spécifiques (phagocytose, apoptose/nécrose, cicatrisation, chimiotaxisme, invasion, migration, sphéroïdes/organoïdes, ...) par imagerie en champ clair et en fluorescence. Cette liste n’est pas exhaustive. Les éléments suivants (non exhaustifs également) représenteront un avantage sur la valeur technique : possibilité de reconstruction de l’ensemble d’un puit photographié à fort grossissement par stitching, possibilité d’intégration de technologie d’intelligence artificielle sur certains tests, possibilité de classification de cellules basées sur leurs morphologies, possibilité de tests standardisés grâce à des kits qui permettent i) une mise au point plus facile et standardisé du test et ii) un traitement de données et une compilation facilitée pour utilisation dans les objets de divulgation scientifique (articles, présentation, conf, mémoire de thèse), système de sécurisation et traçabilité des données, « modulabilité » de l’appareil c’est- à-dire : possibilité d’augmenter le nombre de plaques/flasques par expérience sur le plateau, d’indépendantisation des paramètres pour chaque plaque sur le même support, d’augmenter le nombre de canaux fluorescent, etc)Le système d’analyse devra comprendre le module d’imagerie automatisée (contraste de phase et fluorescence), incluant l’ensemble des objectifs, filtres et modules nécessaires (au minimum 3 grossissements et 2 canaux de fluorescence) ainsi que l’environnement techniques requis (câbles, alimentation) etc. Il doit intégrer un logiciel d’acquisition, d’analyse et de compilation des données dans la station de travail adéquate permettant de faciliter leur traitement et leur gestion. Le traitement des données devra pouvoir se faire sur un poste de travail indépendant de l’appareil et avec plusieurs licences utilisateurs. L’incubateur dans lequel sera placé l’appareil n’est pas prévu dans cet appel.Une attention particulière sera également portée sur les conditions de livraison, vérification technique, mise en service et formation ainsi que sur les garanties, la prise en charge et les délais d’intervention en cas de panne, mais aussi sur les politiques de transition écologique et de responsabilité sociétale portées par les candidats.